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提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

  近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。

  全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

  统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

  相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

  该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

  与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。

  该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

 

中国社会汽车保有量超3亿辆 千人汽车拥有量达220辆******

  中新网广州12月31日电 (记者 许青青)记者从31日举行的中国·广州汽车产业大会系列活动开幕式上获悉,中国社会汽车保有量超过3亿辆,千人汽车拥有量达到220辆。

  第二十届广州国际汽车展览会已于30日开幕,将持续至2023年1月8日。中国对外贸易中心党委书记、主任储士家在致辞中指出,本届广州汽车展是广交会展馆四期启用后迎来的第一场大展,也是本年度国内唯一举办的A级车展,具有重要意义。本届广州汽车展以“新科技、新生活”为主题,展览面积22万平方米,来自全球的89家车企倾情参与。广州汽车展已成为国内外最具影响力的国际汽车展览会之一,被誉为“中国汽车市场发展风向标”,成为广州市重要的城市名片。

  中国机械工业联合会会长徐念沙视频致辞时介绍,汽车作为中国国民经济的支柱产业,产品产量连续多年居世界首位。目前,中国规模以上汽车制造企业超过1.7万家,用工人数超过400万人。中国品牌乘用车市场份额达到47.2%。中国社会汽车保有量超过3亿辆,千人汽车拥有量达到220辆。今年1月至11月,汽车产销分别超过2400万辆,同比分别增长6.1%和3.3%。其中新能源汽车产销分别超过600万辆,出口59.3万辆,同比均增长1倍。中国汽车不仅为世界汽车产业发展做出突出贡献,也为稳定中国国民经济基本盘、实现“六保”“六稳”做出了重要贡献。

  大会还举行了汽车产业强链补链项目集中签约仪式,签约项目34个,包括招商项目和增资扩产项目,涉及白云区、番禺区、黄埔区、增城区、南沙区、花都区等6个区。

  据悉,车展期间,广州市还将同期举办中国·广州汽车产业发展大会系列活动,包括主题论坛、智能网联汽车驾驶大赛、智能网联汽车技术大会等。(完)

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